该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅理想的。
生物导体版本:3.9
该软件包为RNA序列数据集的交互式差分表达分析提供了功能,以快速有效地提取下游差异表达的步骤。闪亮的应用程序封装了整个软件包。
作者:费德里科·马里尼(Federico Marini)[AUT,CRE]
维护者:uni-mainz.de>的Federico Marini
引用(从r内,输入引用(“理想”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“理想”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“理想”)
html | R脚本 | 理想用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 差异性,,,,GUI,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,免疫学,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,报告写作,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.8.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | topgo |
进口 | deseq2,,,,总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,GGPLOT2(> = 2.0.0),D3 -HeatMap,,,,pheatmap,,,,PCAEXPLORER,,,,ihw,,,,GPLOTS,,,,insctr,,,,Goseq,,,,Stringr,,,,dplyr,,,,林玛,,,,gostats,,,,go.db,,,,AnnotationDbi,,,,闪亮的(> = 0.12.0),发光的dashboard,,,,丝绸,,,,DT,,,,Rentrez,,,,Rintrojs,,,,Ggrepel,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,闪亮,,,,生物比较,grdevices,base64enc, 方法 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,呼吸道,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,变形,,,,EDGER |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/federicomarini/idealhttps://federicomarini.github.io/ideal/ |
BugReports | https://github.com/federicomarini/ideal/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Ideal_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | Ideal_1.8.1.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Ideal_1.8.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ideal |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/理想 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ideal/ |
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