isobar

doi：10.18129/b9.bioc.isobar

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅isobar。

分析和定量标记的MSMS蛋白质组学数据

生物导体版本：3.9

ISOBAR提供了用于分析具有同类标签（例如ITRAQ和TMT）标记的定量质谱蛋白质组学数据的预处理，归一化和报告生成的方法。功能用于集成和验证PTM中心数据集（ISOBAR-PTM）的模块。有关http://www.ms-isobar.org的更多信息。

作者：florian p breitwieser 和jacques colinge ，并在alexey stukalov 的贡献中.ch>和florent gluck

维护者：florian p breitwieser

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ isobar”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ isobar”）

PDF	R脚本	开发人员的iSobar2021欧洲杯体育投注开户
PDF	R脚本	用于量化PTM数据集的ISOBAR
PDF	R脚本	ITRAQ和TMT蛋白定量的ISOBAR包装
PDF	R脚本	Isobar软件包的用途
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物信息学，，，，免疫学，，，，质谱，，，，多蛋白酶，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件
版本	1.30.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（8年）
执照	LGPL-2
要看	r（> = 2.10.0），生物酶，统计，方法
进口	干扰，，，，plyr，，，，Biomart，，，，GGPLOT2
链接
建议	MSNBase，，，，orgmassspecr，，，，XML，，，，rjsonio，，，，HMISC，，，，GPLOTS，，，，rcolorbrewer，，，，栅格，，，，林玛，，，，引导，，，，DBI，，，，大量的
系统要求
增强
URL	https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports	https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我	rforpoteomics
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	isobar_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	isobar_1.30.0.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.11（El Capitan）	isobar_1.30.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isobar
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/isobar
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/isobar/
软件包下载报告	下载统计