此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见墨西拿.
Bioconductor版本:3.9
Messina是一组算法,用于构建最优鲁棒的单基因分类器,并用于识别存在异常值或未知样本子组的差异表达。该方法可应用于鉴别用于临床检测(诊断和预后)的先导特征,以及当一小部分样本显示不寻常的表达模式时识别差异表达。
作者:Mark Pinese [aut], Mark Pinese [cre], Mark Pinese [cph]
维护者:Mark Pinese
引用(从R中,输入引用(“墨西拿”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("messina")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“墨西拿”)
R脚本 | 使用墨西拿 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,分类,DifferentialExpression,GeneExpression,软件,生存 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | EPL (> = 1.0) |
取决于 | R (> = 3.1.0),生存(> = 2.37 4)方法 |
进口 | Rcpp(> = 0.11.1),plyr(> = 1.8),ggplot2(>= 0.9.3.1),网格(>= 3.1.0),foreach(> = 1.4.1),图形 |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr(> = 1.5),antiProfilesData(> = 0.99.2),Biobase(> = 2.22.0),BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | doMC(> = 1.3.3) |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | messina_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | messina_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | messina_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/messina |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/墨西拿 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/messina/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: