miRsponge

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRsponge

这个包是弃用．它可能会被从生物导体中移除。请参阅包临终的指导方针为更多的信息。

此包适用于Bioconductor的3.9版。这个包已经从Bioconductor中移除。有关最后一个稳定的、最新的发布版本，请参见miRsponge(改名为mirsponge)。

miRNA海绵相互作用网络和模块的鉴定和分析

Bioconductor版本:3.9

miRsponge包名称修改为“miRsponge”。未来的更新将在mirsponge包(//www.andersvercelli.com/packages/miRspongeR/)中看到。该软件包提供了研究miRNA海绵(也称为ceRNA或miRNA诱饵)的几个功能，包括识别miRNA海绵相互作用的常用方法，以及整合不同方法的miRNA海绵相互作用的集成方法，以及验证miRNA海绵相互作用的功能。并推断miRNA海绵模块，对模块进行富集分析，对模块进行生存分析。

作者:Junpeng张

维护者:张俊鹏

安装

要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!安装软件包(“BiocManager”)

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“miRsponge”)

超文本标记语言	R脚本	miRNA海绵:鉴定和分析miRNA海绵相互作用网络和模块
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，GeneExpression，微阵列，NetworkEnrichment，软件，生存
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	corpcor平行,igraph，制程，clusterProfiler，ReactomePA，剂量，生存， grDevices，图形，统计，varhandle，linkcomm跑龙套,Rcpp，org.Hs.eg.db
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	miRsponge_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	miRsponge_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	miRsponge_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRsponge
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRsponge
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/miRsponge/
包下载报告	下载数据