多lust

doi：10.18129/b9.bioc.multiclust

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅多lust。

多lust：用于识别癌症转录组轮廓中生物学相关簇的R包装

生物导体版本：3.9

进行聚类以识别转录组学特征的模式，以确定患者的临床相关亚组。特征（基因）选择是过程的关键和组成部分。当前，有许多特征选择和聚类方法来识别相关基因并执行样品的聚类。但是，选择适当的方法很难。此外，可用软件包尚未支持广泛的特征选择方法。因此，我们开发了一种称为Multiclust的综合R包装，使研究人员可以轻松地尝试选择基因选择和聚类的方法的组合。使用Multic -Lust，我们在临床结局的背景下确定了最佳性能聚类方法。我们的观察结果表明，只要选择了适当的基因数量，诸如基于方差的排名之类的简单方法（基于方差的排名）在大多数数据集上表现良好。但是，由于没有方法对所有研究都起作用，因此不同的基因排名和选择方法仍然相关。

作者：Nathan Lawlor [AUT，CRE]，Peiyong Guan [aut]，Alec Fabbri [aut]，Krish Karuturi [aut]，Joshy George [aut]

维护者：gmail.com上的Nathan Lawlor

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ multiclust”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“多lust”）

html	R脚本	多层性指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	聚类，，，，特征提取，，，，基因表达，，，，软件，，，，生存
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（3。5年）
执照	GPL（> = 2）
要看
进口	mclust，，，，CTC，，，，生存，，，，簇，，，，Dendextend，，，，一张地图，图形，grdevices
链接
建议	尼特，，，，GPLOTS，，，，运行，，，，生物基因，，，，预处理，，，，生物酶，，，，地球
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	MULTICLUST_1.14.0.TAR.GZ
Windows二进制	MULTICLUST_1.14.0.ZIP
Mac OS X 10.11（El Capitan）	MulticLust_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiclust
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/multiclust
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/multiclust/
软件包下载报告	下载统计