这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见multiMiR.
Bioconductor版本:3.9
来自外部资源的microrna /靶标的集合,包括验证的microrna靶标数据库(miRecords, miRTarBase和TarBase),预测的microrna靶标数据库(DIANA-microT, ElMMo, microcosmos, miRanda, miRDB, PicTar, PITA和TargetScan)和microrna疾病/药物数据库(miR2Disease, Pharmaco-miR VerSe和PhenomiR)。
作者:Ru元彬[aut], Matt Mulvahill [cre, aut], Spencer Mahaffey [aut], Katerina Kechris [aut, cph, ths]
维护者:Matt Mulvahill < Matt。Mulvahill在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“multiMiR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("multiMiR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“multiMiR”)
超文本标记语言 | R脚本 | 多红外用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,OrganismData,Rattus_norvegicus_Data,软件,miRNAData |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2年) |
许可证 | MIT +文件许可 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 统计数据,XML,RCurl,purrr(> = 0.2.2),宠物猫(>= 1.2),方法BiocGenerics,AnnotationDbi,dplyr |
链接 | |
建议 | BiocStyle,刨边机,knitr,rmarkdown,testthat(> = 1.0.2中) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/KechrisLab/multiMiR |
BugReports | https://github.com/KechrisLab/multiMiR/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | multiMiR_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | multiMiR_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | multiMiR_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiMiR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multiMiR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/multiMiR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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