核素

doi:10.18129/b9.bioc.nucleosim

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅核素

生成合成核小体图

生物导体版本:3.9

该软件包可以生成一个合成图,其读取覆盖核小体区域以及带有正向和反向读取的合成图,以模拟下一代测序。用户可以在读取定位的三个不同分布之间进行选择:正常,学生和统一。

作者:Rawane Samb [aut],AstridDeschê​​nes[CRE,AUT],Pascal Belleau [aut],Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes >

引用(从r内,输入引用(“核素”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ nucleosim”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“核素”)

html R脚本 生成合成核小体图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,遗传学,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(3。5年)
执照 艺术2.0
要看
进口 统计,iranges,,,,S4VECTORS,图形,方法
链接
建议 生物使用,,,,生物基因,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,运行
系统要求
增强
URL https://github.com/arnauddroitlab/nucleosim
BugReports https://github.com/arnauddroitlab/nucleosim/issues
取决于我
进口我
建议我 RJMCMCN核小体
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 nucleosim_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 nucleosim_1.12.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) nucleosim_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nucleosim
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nucleosim
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/nucleosim/
软件包下载报告 下载统计

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