plyranges

doi:10.18129/b9.bioc.pherranges

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅plyranges

操纵基因组机械的流利界面

生物导体版本:3.9

与常见的生物导体类范围和基因组晶体相互作用的DPLYR样界面。通过提供一种语法和一致的方式来操纵这些课程,他们为新的生物导体使用者提供了访问权限。

作者:Stuart Lee [AUT,CRE],Michael Lawrence [AUT,CTB],Dianne Cook [AUT,CTB]

维护者:Stuart Lee

引用(从r内,输入引用(“ plyranges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ plyranges”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ plyranges”)

html R脚本 介绍
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件,,,,工作流程
版本 1.4.4
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(1。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5),方法,生物基因,,,,iranges(> = 2.12.0),基因组机(> = 1.28.4)
进口 dplyr,,,,rlang(> = 0.2.0),马格里特,,,,tidyselect,,,,rtracklayer,,,,基因组签名,,,,GenomeInfodB,,,,rsamtools,,,,S4VECTORS(> = 0.17.41),UTILS
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,GGPLOT2,,,,Helloranges,,,,Hellorangesdata,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,pasillabamsubset,,,,COVR
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/sa-lee/plyranges
取决于我
进口我
建议我 结构视频隔离
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 plyranges_1.4.4.4.tar.gz
Windows二进制 plyranges_1.4.4.4.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) plyranges_1.4.4.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plyranges
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/plyranges
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/plyranges/
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