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proBAMr
DOI:10.18129 / B9.bioc.proBAMr
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅proBAMr。
生成山姆文件psm的猎枪蛋白质组学数据
Bioconductor版本:3.9
映射psm回基因组。包构建山姆从猎枪蛋白质组学数据文件包还提供了函数注释从GTF文件做准备。
作者:小菁王
维护人员:小菁王<小菁。王在vanderbilt.edu >
从内部引用(R,回车引用(“proBAMr”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“proBAMr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“proBAMr”)
| R脚本 | 介绍proBAMr | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件,可视化 |
| 版本 | 1.18.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0.1),IRanges,AnnotationDbi |
| 进口 | GenomicRanges,Biostrings,GenomicFeatures,rtracklayer |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | proBAMr_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | proBAMr_1.18.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | proBAMr_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proBAMr |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ proBAMr |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/proBAMr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
