pvac

DOI:10.18129 / B9.bioc.pvac

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见pvac

基于pca的Affymetrix阵列基因过滤

Bioconductor版本:3.9

该包包含了通过第一主成分(PVAC)所占的变异比例来过滤基因的功能。

作者:吕俊,皮埃尔·r·布歇尔

维护者:Jun Lu , Pierre R. Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>

引文(从R内,输入引用(pvac)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("pvac")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (pvac)

PDF R脚本 基于pca的Affymetrix基因芯片的基因过滤
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel质量控制软件
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(8.5年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 2.8.0)
进口 affy(>= 1.20.0), stats,Biobase
链接
建议 pbapplyaffydataALLMLLgenefilter
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 pvac_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 pvac_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) pvac_1.32.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvac
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pvac
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pvac/
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