rbiopaxparser

doi:10.18129/b9.bioc.rbiopaxparser

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅rbiopaxparser

解析Biopax文件并在R中代表它们

生物导体版本:3.9

解析Biopax文件并在R中代表它们,目前支持Biopax级别2和3级。

作者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)

维护者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)

引用(从r内,输入引用(“ rbiopaxparser”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rbiopaxparser”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ rbiopaxparser”)

PDF R脚本 rbiopaxparser小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,软件
版本 2.24.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.0.0),Data.Table
进口 XML
链接
建议 rgraphviz,,,,rcurl,,,,图形,,,,运行,,,,生物基因,,,,NEM,,,,rbgl,,,,Igraph
系统要求
增强
URL https://github.com/frankkramer-lab/rbiopaxparser
取决于我
进口我 AnnotationHubdata,,,,杂种
建议我 AnnotationHub,,,,NetPathminer
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 rbiopaxparser_2.24.0.tar.gz
Windows二进制 rbiopaxparser_2.24.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) rbiopaxparser_2.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rbiopaxparser
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rbiopaxparser
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/rbiopaxparser/
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  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户