该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅rbiopaxparser。
生物导体版本:3.9
解析Biopax文件并在R中代表它们,目前支持Biopax级别2和3级。
作者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)
维护者:弗兰克·克莱默(Frank Kramer)
引用(从r内,输入引用(“ rbiopaxparser”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rbiopaxparser”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rbiopaxparser”)
R脚本 | rbiopaxparser小插图 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,软件 |
版本 | 2.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.0.0),Data.Table |
进口 | XML |
链接 | |
建议 | rgraphviz,,,,rcurl,,,,图形,,,,运行,,,,生物基因,,,,NEM,,,,rbgl,,,,Igraph |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/frankkramer-lab/rbiopaxparser |
取决于我 | |
进口我 | AnnotationHubdata,,,,杂种 |
建议我 | AnnotationHub,,,,NetPathminer |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rbiopaxparser_2.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | rbiopaxparser_2.24.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rbiopaxparser_2.24.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rbiopaxparser |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rbiopaxparser |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rbiopaxparser/ |
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