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sapFinder
DOI:10.18129 / B9.bioc.sapFinder
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sapFinder。
包变体肽在猎枪蛋白质组学检测和可视化。
Bioconductor版本:3.9
sapFinder开发自动化(1)variation-associated数据库建设、数据库搜索(2),(3)后处理,(4)基于html报告生成猎枪蛋白质组学。
作者:Shaohang徐,Bo温家宝
维护人员:徐Shaohang < xsh。斯凯在gmail.com >, Bo温家宝<文博genomics.cn >
从内部引用(R,回车引用(“sapFinder”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sapFinder”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“sapFinder”)
| R脚本 | sapFinder装饰图案 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,RNASeq,ReportWriting,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.0.0),rTANDEM(> = 1.3.5) |
| 进口 | pheatmap,Rcpp(> = 0.10.6)、图形、grDevices统计,跑龙套 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | sapFinder_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sapFinder_1.22.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | sapFinder_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sapFinder |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sapFinder |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/sapFinder/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
