该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅签名者。
生物导体版本:3.9
签名程序包提供了一种经验性的贝叶斯方法来进行突变签名发现。它旨在分析癌症基因组中的单核苷酸变异子(SNV)计数,但也可以应用于其他特征。还提供了根据暴露模式表征特征或基因组样本的功能。
作者:拉斐尔·罗萨莱斯(Rafael Rosales),罗德里戈·德拉蒙德(Rodrigo Drummond),雷南·瓦利里斯(Renan Valieris),以色列Tojal da Silva
维护者:Renan Valieris
引用(从r内,输入引用(“签名者”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ signer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“签名”)
html | R脚本 | 签名者 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因组变量,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,统计信息,,,,可视化 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(3年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 变体,,,,NMF |
进口 | 生物基因,,,,生物弦,,,,班级,图形,grdevices,基因组机,,,,nloptr,方法,统计,utils,PMCMR |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo(> = 0.7.100) |
建议 | 尼特,,,,rtracklayer,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | https://github.com/rvalieris/signer |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | signer_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | signer_1.10.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | signer_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/signer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/签名者 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/signer/ |
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