签名者

doi:10.18129/b9.bioc.signer

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅签名者

经验贝叶斯的突变签名发现方法

生物导体版本:3.9

签名程序包提供了一种经验性的贝叶斯方法来进行突变签名发现。它旨在分析​​癌症基因组中的单核苷酸变异子(SNV)计数,但也可以应用于其他特征。还提供了根据暴露模式表征特征或基因组样本的功能。

作者:拉斐尔·罗萨莱斯(Rafael Rosales),罗德里戈·德拉蒙德(Rodrigo Drummond),雷南·瓦利里斯(Renan Valieris),以色列Tojal da Silva

维护者:Renan Valieris

引用(从r内,输入引用(“签名者”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ signer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“签名”)

html R脚本 签名者
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因组变量,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,统计信息,,,,可视化
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(3年)
执照 GPL-3
要看 变体,,,,NMF
进口 生物基因,,,,生物弦,,,,班级,图形,grdevices,基因组机,,,,nloptr,方法,统计,utils,PMCMR
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo(> = 0.7.100)
建议 尼特,,,,rtracklayer,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/rvalieris/signer
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 signer_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 signer_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) signer_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/signer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/签名者
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/signer/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题: