该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅规格。
生物导体版本:3.9
提供了用于生成光谱库的函数,可用于蛋白质组学中的MRM SRM MS工作流程。该软件包提供了Bibliospec读取器,该功能可以使用FastA格式化的氨基酸文件添加蛋白质信息,以及用于在Spectronaut软件中使用创建库的导出方法。
作者:克里斯蒂安·潘斯[AUT,CRE],乔纳斯·格罗斯曼[aut],Christian Trachsel [Aut],Witold E. Wolski [CTB]
维护者:Christian Panse
引用(从r内,输入引用(“ Specl”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ specl”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ specl”)
html | R脚本 | 自动工作流程 |
R脚本 | 规格简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件 |
版本 | 1.18.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.6),DBI(> = 0.5),方法(> = 3.3),PROTVIZ(> = 0.4),rsqlite(> = 1.1),seqinr(> = 3.3) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物基因,,,,生物使用(> = 2.2),尼特(> = 1.15),rmarkDown,,,,运行(> = 0.4) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/specl/ |
BugReports | https://github.com/fgcz/specl/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | MSQC1,,,,雏形 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | specl_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | specl_1.18.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | specl_1.18.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/specl |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/specl |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/specl/ |
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