这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见srnadiff.
Bioconductor版本:3.9
不给予参考注释时小RNA-seq的差异表达。
作者:Zytnicki Matthias [aut, cre]
维护者:Matthias Zytnicki < Matthias。Zytnicki在inra.fr>
引文(从R内,输入引用(“srnadiff”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("srnadiff")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“srnadiff”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 报道,DifferentialExpression,表观遗传学,GeneExpression,ImmunoOncology,预处理,SmallRNA,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.7 (R-3.5)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.5) |
进口 | Rcpp(>= 0.12.8),方法,utils,devtools,BiocStyle,S4Vectors,GenomeInfoDb,rtracklayer,SummarizedExperiment,IRanges,GenomicRanges,DESeq2,Rsamtools,GenomicFeatures,GenomicAlignments,ggplot2,BiocParallel |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | srnadiff_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | srnadiff_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | srnadiff_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srnadiff |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/srnadiff |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/srnadiff/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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