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ConnectivityMap
DOI:10.18129 / B9.bioc.ConnectivityMap
这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ConnectivityMap。
功能之间的连接药物、基因和疾病所揭示的常见基因表达的变化
Bioconductor版本:3.9
Broad研究所的连接图(cmap02)是一个“大型参考目录培养的人类细胞的基因表达数据的摄动与许多化学物质和基因试剂”,包含超过7000个基因表达谱和1300小分子。
作者:保罗·香农
维修工:保罗·香农< pshannon systemsbiology.org >
从内部引用(R,回车引用(“ConnectivityMap”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ConnectivityMap”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CancerData,ExperimentData,MicroarrayData |
| 版本 | 1.20.0 |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.15.1) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ConnectivityMap_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ConnectivityMap |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ConnectivityMap |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ConnectivityMap/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
