ihwpaper

doi：10.18129/b9.bioc.ihwpaper

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅ihwpaper。

在IHW纸中复制数字

生物导体版本：3.9

该软件包便利地包装了在IHW纸中重现数字所需的所有功能（https://www.nature.com/articles/articles/nmeth.3885）和根据http://arxiv.orgs/1701.05179提供的最新ARXIV Preprint。因此，它是生物导体IHW软件包的配套软件包。

作者：Nikos Ignatiadis [AUT，CRE]

维护者：nikos ignatiadis

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ihwpaper”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ ihwpaper”）

html	R脚本	NMETH纸：解释TDR
html	R脚本	NMETH纸：IHW-Bonferroni模拟
html	R脚本	NMETH纸：真实的数据示例
html	R脚本	NMETH纸：模拟图
html	R脚本	NMETH纸：分层直方图
html	R脚本	统计文件：IHW-Benjamini-Yekutieli的HQTL分析
html	R脚本	统计论文：IHW审查和楼层模拟
html	R脚本	各种：BH解释 /可视化
html	R脚本	各种：适用于IHW的Grenander估计器（VS ECDF）
html	R脚本	各种：实际数据示例：1倍重量功能
html	R脚本	各种：TDR和PVALUE排斥区域
html	R脚本	各种：权重与独立过滤
PDF		参考手册

细节

生物浏览	实验数据，，，，表达数据，，，，rnaseqdata，，，，reproducibleresearch
版本	1.12.0
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.3），ihw
进口	RCPP，统计，细条，方法，utils，deseq2，，，，总结性特征，，，，fdrtool，，，，GeneFilter，，，，QVALUE，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，生物比较，，，，dplyr， 网格，GGPLOT2，，，，牛仔图
链接	RCPP
建议	测试，，，，rcolorbrewer，，，，韦桑森，，，，秤，，，，栅格，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，呼吸道，，，，帕西拉，，，，deseq，，，，locfdr，，，，花花公子，，，，GGBIO，，，，LATEX2EXP
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ihwpaper_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11（El Capitan）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ihwpaper
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ihwpaper
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ihwpaper/
软件包下载报告	下载统计