RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14。

对齐读取从RNAseq实验:高通量测序转录剖析的HNRNPC击倒和控制海拉细胞

Bioconductor版本:3.9

包包含8 BAM文件,1 /测序运行。每个BAM文件是通过(1)调整读取(paired-end)与TopHat2完整hg19基因组,然后(2)构造子集只保留chr14比对。看到加入数字e - mtab - 1147 ArrayExpress数据库中有关实验的细节,包括链接到发表的研究(Zarnack et al ., 2012)和FASTQ文件。

作者:Herve页面

维修工:Herve页< hpages fredhutch.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ArrayExpress,ExperimentData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,NCI,RNASeqData,SequencingData
版本	0.22.0
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	GenomicAlignments,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
取决于我	samExploreR,测序
进口我
建议我	BiocParallel,GenomicAlignments,GenomicFiles,GenomicRanges,咆哮,Rsamtools,SplicingGraphs
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.22.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
包下载报告	下载数据