策划的元素元素

doi:10.18129/b9.bioc.CuratedMetagenomicData

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅策划的元素元素

人类微生物组策划的宏基因组数据

生物导体版本:3.9

策划的元素元素套件为从不同胸腔收集的样品提供了微生物分类,功能和基因标记丰度。

作者:lucas Schiffer ,edoardo pasolli ,livi waldron gmail.com>,faizankmalikmalik2012 at yahoo.com>,yahoo.com>,yahoo.com>,valerie obenchain ,Morgan Martin

维护者:lucas schiffer

引用(从r内,输入引用(“策展元原核达塔”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“策划metagenogenomicdata”)

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文档

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browsevignettes(“策展胶质培根”)

html R脚本 策划的元素元素
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 实验数据,,,,实验室,,,,homo_sapiens_data,,,,微生物瘤,,,,reproducibleresearch
版本 1.14.1
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.6.0),AnnotationHub(> = 2.9.0),生物酶(> = 2.37.0),dplyr(> = 0.5.0),实验室(> = 1.3.0)
进口 马格里特, 方法,S4VECTORS,,,,花花公子,UTILS
链接
建议 ,,,,COVR,,,,生物检查,,,,生物管理器,,,,生物比较,,,,生物使用,,,,DevTools,,,,GGPLOT2,,,,尼特,,,,元基因组,,,,门索,,,,readr,,,,rism,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/waldronlab/curatedmetagenomicdata
BugReports https://github.com/waldronlab/curatedmetagenomicdata/issues
取决于我
进口我
建议我 HMP16SDATA,,,,metavizr
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 策划的素烯醇化_1.14.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/curatedMetagenomicdata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/curatedmetagenomicdata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/curatedMetagenomicdata/
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