注释

DOI:10.18129 / B9.bioc.annotation

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见注释。

基因组注释资源

Bioconductor版本:3.9

注释资源在Bioconductor项目中占很大比例。此外，还有各种各样的在线资源可供使用，这些资源可以使用特定的软件包访问。本演练将描述这些资源中最流行的，并给出一些关于如何使用它们的高级示例。

作者:Marc RJ Carlson [aut]， Herve Pages [aut]， Sonali Arora [aut]， Valerie Obenchain [aut]， Martin Morgan [aut]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("annotation")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“注释”)

超文本标记语言	R脚本	注释基因组范围
超文本标记语言	R脚本	基因组注释资源

细节

biocViews	AnnotationWorkflow，工作流
版本	1.8.1
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3.0)，VariantAnnotation，AnnotationHub，Organism.dplyr，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，Homo.sapiens，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，biomaRt，BSgenome，TxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/help/workflows/annotation/Annotation_Resources/
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	annotation_1.8.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotation
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/annotation
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/annotation/
软件包下载报告	下载数据