APL

DOI:10.18129 / B9.bioc.APL

协会的情节

Bioconductor版本:发行版(3.16)

APL是一个用于关联图(AP)计算的包，AP是一种单细胞转录组数据可视化和分析的方法。APL的主要重点是从输入数据中识别单个细胞集群的特征基因。该软件包执行对应分析(CA)，并允许使用关联图识别集群特定的基因。此外，APL计算所有基因的集群特异性得分，允许根据基因的特异性对所选细胞集群进行排序。

作者:Elzbieta Gralinska [cre, aut]， Clemens Kohl [aut]， Martin Vingron [aut]

维护者:Elzbieta Gralinska < Gralinska at molgen.mpg.de>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("APL")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

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超文本标记语言	R脚本	使用APL分析数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，RNASeq，测序，SingleCell，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	R (>= 4.2)
进口	网状，ggrepel，ggplot2，viridisLite，情节，修拉，SingleCellExperiment，magrittr，SummarizedExperiment，topGO，方法，统计，效用，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，rlang
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，scRNAseq，嘘，食物，testthat
SystemRequirements	Python, pytorch, numpy
增强了
URL
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进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	APL_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	APL_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	APL_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/APL
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/APL
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/APL/
软件包下载报告	下载数据