BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

功能相似

Bioconductor版本:发行版(3.16)

根据KEGG和REACTOME或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以计算路径或基因集、基因或集群，并与其他相似性相结合。它们可以用来改善网络、基因选择、测试关系……

作者:Lluís雷维拉·桑丘[aut, cre]， Pau Sancho-Bru [ths]，胡安José萨尔瓦泰拉·洛萨诺[ths]

维护者:Lluís Revilla Sancho

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BioCor”)

超文本标记语言	R脚本	关于BioCor
超文本标记语言	R脚本	生物ocor的高级用法
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，网络，NetworkEnrichment，通路，软件，StatisticalMethod，SystemsBiology
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	BiocParallel，GSEABase，矩阵、方法
链接
建议	气道，BiocStyle，引导，DESeq2，GOSemSim，Hmisc，knitr(> = 1.35),org.Hs.eg.db，reactome.db，rmarkdown，拼写，targetscan.Hs.eg.db，testthat，WGCNA
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/BioCorhttps://llrs.github.io/BioCor/
BugReports	https://github.com/llrs/BioCor/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BioCor_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	BioCor_1.22.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BioCor_1.22.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BioCor_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioCor
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BioCor/
软件包下载报告	下载数据