生物相投

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocParallel

Bioconductor设施并行评估

生物导体版本:发布(3.13)

此包提供了用于并行评估的修改版本和新颖实现,用于与生物导体对象一起使用。

作者:Biocumond Package维护者[CRE],Martin Morgan [Aut],Valerie Obenchain [Aut],Michel Lang [Aut],Ryan Thompson [Aut],Nitesh Turaga [Aut],Aaron LUN [CTB]

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“生物共同”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!procenameSpace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager :: install(“Biocomallels”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

browseVignettes(“BiocParallel”)

PDF. r script. 1.介绍BiocParallel
PDF. r script. 2. Batchtoolsparam简介
PDF. r script. 3.错误,日志和调试
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 基础设施软件
版本 1.26.0
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(7.5岁)
执照 GPL-2 |GPL-3
依靠 方法
进口 统计数据,Util,徒劳。霍尔格, 平行,
链接到 BH.
建议 生物根系、工具、Foreach.BatchJobsBBMISC.doParallelRMPI.Genomicranges.rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14.TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneVariantAnnotation.RSAMTOOLS.基因管理缩短Codetools.运行BiocStyleknbatchtoolsdata.table.
SystemRequirements C ++ 11.
加强
URL. https://github.com/Bioconductor/BiocParallel
Bugreports. https://github.com/bioconductor/biocomparlallel/issues.
取决于我 培根清楚红衣主教classifyr.Clusterseq.共识撰稿人迪科DEWSeqDexseq.DMCFB.DMCHMM.DOPPELGANGR.DSS.盛宴弗雷泽基因组夫妇HireadsProcessor.检查事情Mbased.metageneMetagene2.ncgtwOriposope.探险者PCAN.periodicDNAProMoC.rqc.测序缩短sigcheck.光谱Strome4.摘要博马克SVA.variancepartition.XCMS.
进口我 ABSEQR.admumute.AffiXcanaldex2.alphabeta.阿尔卑斯山脉阿尔普斯纳姆扩增人asics.aspediafi.atsnp.Bambu.匪徒基本batchelor.贝诺Biocneighbors.生物主学生物贴眼BioMMBioNEROBionetstat.生物墨呢Biscuiteer.吹风丝布伦德布bsseqCageFightr.蛋糕Cellbaser.CellBench克里米尔CellMixSCENSCET.chipexoqual.ChIPQCChromscape.ChromSchitch.Chromvar.CNVRangerCogaps.调味品consensusDEcontcoregx.COSEQ.cpvsnp.Crispseek.Crisprvariants.CSAW.Cydar.cytoglmm.Cytomapper.司布dcgsa.黛米卡decomplexdisease.德内捷德descan2.deseq2.Desingle.困惑DMRSEQ.剂量德里姆瑟克Dropletuls.沙丘easyrnaseq.EMDomicsermaerssa.逃脱exoMepeak2.exphuntersuite.FGSEA.findmyfriends.FlowCatchr.弗洛克斯普克斯gdcrnatools.genogam.基因管理GenotyPeeval.GMAPR.Gscreend.GSEABENCHMARMARR.GSVA.GUIDESEQ.H5VCHiCBrickshiccompare.htseqgenie.htsfilter.iasva冰茶理想的IHWpaperIMAS.inpas.兴趣电离IPOIsanalytics.IVAS.kinswingr.线程普利lisaClustloci2path.洛卡马LRCell.宏伟MBKmeans.麦克巴斯特metabomxtr.METASEQR2.Methcp.MethylAidmethylGSA甲基术甲基座MetNet米娅梅维兹米格莎milMinfi.MIQC筹码mmapp2.Mogamun.MotifBreakr.mpranalyze.MsBackendMassbankMsBackendMgfMSnbaseMSQROB2.MSSTATSSAMPLESIZE.多种审核穆斯萨马斯喀特nbamseq.nbsplice.NPARC.omicslonda.ORFikOVESEG锥形pcatools.PDATK.Pharmacogx.pipecomp.摇篮PrecisionTrialDrawer.Proactiv.proFIAprofflewlactiple.QPGraph..QSEA.Quasr.radiogx.RCWL.叙事regenrich.REMPrjmcmcncnucosomes.ramodr.RSAMTOOLS.Ruvcorr.土星Scclassify.scdblfinder.SCDD.SCDE.短链脂肪酸Schot.骗子SCnorm得分invhap.SCPCA.screcover.颈背SCTHI.sc芝麻setools.sigfeature.签名探索singlecelltk.单歌者斯嘉西尔SNPhoodSoggi.Spectraltad.spicyR泼溅拼接照片Srnadiff.Tapseq.tarseqqc.TBSignatureProfiler.Ternarynet.TFBStools.tmixclust.ToxicoGxTPP2DtradeSeqTraReTreeSummarizedExperiment特纳时尚的TsrchitectTVTB.变型滤波器VariantToolsVelociraptor.Waddr.weitrixzinbwave
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跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 biocparallel_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件 BiocParallel_1.26.0.zip
Macos 10.13(高塞拉) biocparallel_1.26.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/biocomallel
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/生物共争
包短网址 https://biocumon.org/packages/biocomparlellal/
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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户