BiocStyle

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocStyle

小插图和其他Bioconductor文档的标准样式

Bioconductor版本:发行版(3.16)

为Bioconductor PDF和HTML文档提供标准格式样式。欧洲杯2021体育彩票包小插图说明使用和功能。

作者:Andrzej oleovich [aut]，迈克·史密斯[ctb]， Martin Morgan [ctb]， Wolfgang Huber [ctb]， Bioconductor Package [cre]

维护者:Bioconductor Package < Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BiocStyle”)

超文本标记语言	R脚本	创作R Markdown小插图
PDF	R脚本	生物导体乳胶风格2.0
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.26.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	bookdown，knitr(> = 1.30),rmarkdown(>= 1.2)， stats, utils，yaml，BiocManager
链接
建议	BiocGenerics，RUnit，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocStyle/issues
全靠我	curatedBreastData，cytofWorkflow，ExpressionAtlas，methylationArrayAnalysis，netresponse，org.Mxanthus.db，Pigengene，rnaseqGene，RnaSeqGeneEdgeRQL，战，sangeranalyseR
进口我	abseqR，ASpli，bandle，BiocWorkflowTools，BPRMeth，BubbleTree，chimeraviz，指南针，德科，DiscoRhythm，FieldEffectCrc，geneXtendeR，GeoMxWorkflows，梅丽莎，meshr，MSnID，PathoStat，PhyloProfile，PhyloProfileData，锐步，regionReport，Rmmquant，Rqc，scMET，scTensor，scTGIF，simpleSingleCell，srnadiff
建议我	王牌，ADAMgui，ADImpute，AffiXcan，affycoretools，aggregateBioVar，AHEnsDbs，AHLRBaseDbs，AHMeSHDbs，AHPathbankDbs，AHPubMedDbs，AHWikipathwaysDbs，ALDEx2，alevinQC，AllelicImbalance，AlpsNMR，AMOUNTAIN，amplican，AneuFinder，微生物，注释，AnnotationDbi，AnnotationFilter，AnnotationForge，AnnotationHub，AnnotationHubData，annotationTools，annotatr，anota2seq，铁砧，AnVILBilling，AnVILPublish，APAlyzer，APL，arrayQualityMetrics，数组，artMS，ASGSCA，亚瑟士，ASICSdata，AssessORF，AssessORFData，分配，ATACseqQC，ATACseqTFEA，atena，atSNP，AUCell，awst，BaalChIP，培根，bamsignals，强盗，banocc，barcodetrackR，basecallQC，基础知识，蛇怪，basilisk.utils，后面;，bayNorm，baySeq，beachmat，beadarray，BeadDataPackR，BEARscc，BEclear，啤酒，benchdamic，benchmarkfdrData2019，BgeeDB，bigmelon，BindingSiteFinder，bioassayR，Biobase，biobtreeR，bioCancer，BiocBaseUtils，BiocCheck，BiocDockerManager，BiocFileCache，BiocIO，BiocMetaWorkflow，BiocNeighbors，BiocOncoTK，BioCor，BiocParallel，BiocPkgTools，BiocSet，BiocSingular，BiocSklearn，biocthis，biocViews，biodb，biodbChebi，biodbExpasy，biodbHmdb，biodbKegg，biodbLipidmaps，biodbMirbase，biodbNcbi，biodbNci，biodbUniprot，BioImageDbs，biomaRt，biomformat，BioMM，BioNERO，BioPlex，biosigner，biotmle，biscuiteer，BitSeq，blacksheepr，blima，blimaTestingData，BloodCancerMultiOmics2017，咆哮，bnbc，BOBaFIT，bodymapRat，北欧化工，brainflowprobes，BrainSABER，分歧点，breakpointR，breakpointRdata，brendaDb，BRGenomics，BridgeDbR，BrowserViz，bsseq，bugsigdbr，BUMHMM，BumpyMatrix，BUScorrect，BUSpaRse，BUSseq，咖啡馆，CAGEfightR，cageminer，篮球选手，CAGEWorkflow，癌症，CancerInSilico，cardelino，红衣主教，CardinalWorkflows，狂欢节，催化剂，cbaf，CBEA，cBioPortalData，cbpManager，ccfindR，ccImpute，ccrepe，celda，CellaRepertorium，CellBarcode，cellbaseR，CellBench，celldex，CelliD，cellity，CellMapper，CellMapperData，CellMixS，cellTree，cellxgenedp，censcyt，Cepo，CexoR，cfDNAPro，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，芝加哥，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPexoQual，ChIPexoQualExample，ChIPpeakAnno，ChIPQC，chipseqDB，chipseqDBData，ChromSCape，chromstaR，chromswitch，CIMICE，CircSeqAlignTk，CiteFuse，ClassifyR，cleanUpdTSeq，切肉刀，限幅器，cliProfiler，CLLmethylation，clusterExperiment，clusterSeq，ClusterSignificance，clustifyr，clustifyrdatahub，cmapR，cn，CNVMetrics，CNVRanger，可可，CoGAPS，cogeqc，我思，comapr，彗星，coMethDMR，compcodeR，CompoundDb，conclus，承认，consensusOV，consensusSeekeR，consICA，CONSTANd，contiBAIT，conumee，CopyhelpeR，CopyNeutralIMA，CopyNumberPlots，文案，警戒线，CoRegNet，CoreGx，科拉尔，coseq，COSMIC.67，cosmiq，COTAN，covRNA，cpvSNP，crisprBowtie，crisprBwa，crisprDesign，crisprScore，crisprScoreData，CRISPRseek，CrispRVariants，crisprVerse，crisprViz，csaw，csawUsersGuide，csdR，CSSQ，CTCF，CTDquerier，ctgGEM，ctsGE，CTSV，curatedBladderData，curatedCRCData，curatedMetagenomicData，curatedOvarianData，curatedTBData，curatedTCGAData，customCMPdb，cydar，CyTOFpower，CytoGLMM，cytoKernel，cytomapper，CytoTree，dada2，dagLogo，DAMEfinder，DaMiRseq，DAPAR，dasper，dcanr，dce，ddPCRclust，debCAM，decompTumor2Sig，decontam，deconvR，解耦，反编排，DEGreport，DelayedArray，DelayedMatrixStats，DelayedRandomArray，DelayedTensor，demuxmix，densvis，部，服饰，depmap，DEqMS，derfinder，derfinderData，derfinderHelper，derfinderPlot，DEScan2，DEWSeq，DExMA，DExMAdata，DEXSeq，DIAlignR，DiffBind，diffcyt，DifferentialRegulation，diffuStats，diffUTR，恐龙，dir.expiry，不和谐的，dittoSeq，DmelSGI，DMRScan，dmrseq，DNABarcodeCompatibility，DNABarcodes，DNAfusion，doppelgangR，多萝西娅，Doscheda，定量给料器，drawProteins，DRIMSeq，DropletTestFiles，DropletUtils，drugTargetInteractions，DSS，dStruct，DuoClustering2018，dupRadar，更容易，easierData，easyreporting，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，EGSEA，EGSEA123，eiR，eisaR，埃尔默，ELMER.data，EmpiricalBrownsMethod，emtdata，EnrichmentBrowser，ensembldb，EpiCompare，EpiDISH，epigraHMM，EpiMix，epimutacions，epimutacionsData，epistack，epistasisGA，EpiTxDb，EpiTxDb.Hs.hg38，EpiTxDb.Mm.mm10，EpiTxDb.Sc.sacCer3，epivizr，epivizrChart，epivizrData，epivizrServer，epivizrStandalone，erma，ERSSA，逃避，EuPathDB，evaluomeR，EventPointer，EWCE，ewceData，excluderanges，ExperimentHub，ExperimentHubData，ExperimentSubset，ExploreModelMatrix，ExpressionNormalizationWorkflow，extraChIPs，FamAgg，famat，FastqCleaner，fastreeR，fCCAC，fCI，fcScan，盛宴，小伙子，FilterFFPE，FindIT2，火焰，flowAI，flowcatchR，flowGraph，flowMap，FlowSOM，flowSpecs，fmcsR，fobitools，弗雷泽，furrowSeg，GA4GHclient，GA4GHshiny，空对空导弹，GBScleanR，gcapc，GDSArray，吉玛。R，genbankr，GeneAccord，GeneExpressionSignature，genefilter，genefu，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，geneplast.data，generegulation，《创世纪》，GeneStructureTools，GeneTonic，GenomAutomorphism，GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicDataCommons，GenomicDistributions，GenomicDistributionsData，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicInteractionNodes，GenomicInteractions，GenomicRanges，GenomicScores，GenomicState，GenomicSuperSignature，GenomicTuples，GenVisR，GeuvadisTranscriptExpr，ggbio，ggmanh，ggmsa，GGPA，ggspavis，GladiaTOX，Glimma，glmGamPoi，glmSparseNet，gmoviz，GMRP，GOexpress，GOfuncR，还装有，goSorensen，goSTAG，gpart软件，gpuMagic，GRaNIE，制粒机，葡萄，图，石墨，GreyListChIP，GRmetrics，groHMM，GSAR，GSE103322，GSE13015，GSE159526，GSE62944，GSEABase，GSEABenchmarkeR，GSEAmining，GSgalgoR，GSVA，GUIDEseq，Gviz，GWAS。贝叶斯，gwascat，gwasurvivr，GWENA，哈曼，HarmanData，杂环胺，HCAData，HD2013SGI，HDCytoData，healthyControlsPresenceChecker，HelloRanges，HelloRangesData，爱马仕，爬虫，HGC，HiCBricks，HiCDOC，HiContacts，HiContactsData，HighlyReplicatedRNASeq，highthroughputassays，Hiiragi2013，希尔达，hipathia，HIREewas，HiTC，HMP16SData，HMP2Data，HPAanalyze，hpAnnot，hpar，HPiP，HTSFilter，HubPub，HumanAffyData，HumanTranscriptomeCompendium，理想的，iGC，IgGeneUsage，igvR，IHW，IHWpaper，illuminaio，imageHTS，ima，imcdatasets，imcRtools，immunoClust，immunotation，infercnv，InPAS，检查，InTAD，InteractionSet，InterCellar，InterMineR，电离，iPath，IRanges，ISAnalytics，iSEE，iSEEhex，iSEEhub，iSEEu，胰岛，isomiRs，iva，JASPAR2022，karyoploteR，kissDE，花边，ldblock，lefser，liftOver，lineagespot，LinkHD，Linnorm，lipidr，lisaClust，loci2path，萝拉，LoomExperiment，LowMACA，lpsymphony，LRBaseDbi，LRcell，LRcellTypeMarkers，m6Aboost，Macarron，MACPET，MACSr，made4，maEndToEnd，MAGeCKFlute，magrene，梅，mAPKL，马尔，微波激射器，MassSpecWavelet，桅杆，MatrixQCvis，MatrixRider，事，工商管理硕士，MBECS，mbkmeans，mbt，MCbiclust，mCSEA，mCSEAdata，餐，肉，MEB，MEDIPS，megadepth，MerfishData，墨西拿，metabCombiner，metabinR，MetaboAnnotation，MetaboCoreUtils，metabolomicsWorkbenchR，MetaboSignal，metagene，metagene2，MetaGxOvarian，MetaGxPancreas，比喻，metapod，metavizr，methimpute，methInheritSim，MethPed，MethReg，MethylAid，MethylAidData，methylCC，methylclock，methylInheritance，MethylMix，MethylSeqData，methylSig，MetNet，mfa，米娅，miaSim，miaViz，微生物组，MicrobiomeBenchmarkData，microbiomeDataSets，microbiomeMarker，MIGSA，miloR，mimager，minfi，minionSummaryData，miQC，米拉，miRcomp，miRmine，miRSM，miRspongeR，mirTarRnaSeq，missMethyl，missRows，mistyR，mixOmics，MMAPPR2，MMAPPR2data，MMDiff2，MMUPHin，moanin，MobilityTransformR，这种款式，Modstrings，MOFA2，mogsa，现代艺术博物馆，蒙娜丽莎，MoonlightR，mosbi，MOSim，Motif2Site，motifbreakR，MotifDb，motifStack，MouseFM，MouseGastrulationData，MouseThymusAgeing，mpra，MQmetrics，MSA2dist，MsBackendMassbank，MsBackendMgf，MsBackendMsp，MsBackendRawFileReader，MsCoreUtils，MsExperiment，MsFeatures，msigdb，msImpute，MSMB，MSnbase，MSPrep，msPurity，msqc1，msqrob2，MSstats，MSstatsLiP，MSstatsLOBD，MSstatsSampleSize，MSstatsTMT，MuData，MultiAssayExperiment，MultiBaC，multicrispr，MultiDataSet，multiGSEA，multiHiCcompare，multiMiR，multiSight，mumosa，MungeSumstats，马斯喀特，muscData，musicatk，MutationalPatterns，MWASTools，mygene，myvariant，mzR，NADfinder，NanoStringDiff，NanoStringQCPro，纳米管，NBSplice，ncGTW，ncRNAtools，ndexr，Nebulosa，NestLink，NetActivity，NetActivityData，netbiov，netboxr，netDx，nethet，netOmics，NetPathMiner，netprioR，netSmooth，NeuCA，NewWave，ngsReports，nnSVG，nondetects，NormalyzerDE，normr，NPARC，npGSEA，nucleoSim，诊断，奥得河，益生元，omicade4，omicRexposome，omicsPrint，omicsViewer，Omixer，OmnipathR，OnassisJavaLibs，OncoScore，OncoSimulR，ontoProc，optimalFlow，optimalFlowData，OPWeight，ORFhunteR，ORFik，Organism.dplyr，orthogene，Oscope，先驱者，OVESEG，PAA，packFinder，莲花，PAIRADISE，pairkat，PanomiR，PANTHER.db，PanViz，parathyroidSE，pareg，parglms，拙劣的模仿，pasilla，PasillaTranscriptExpr，Path2PPI，paxtoolsr，pcaExplorer，PCAN，PCHiCdata，PDATK，PeacoQC，peakPantheR，PepsNMR，PepsNMRData，phantasus，PharmacoGx，phastCons35way.UCSC.mm39，phenomis，phenopath，philr，PhIPData，PhosR，phyloP35way.UCSC.mm39，phyloseq，π，钢琴，pipeComp，plethy，plotGrouper，plyranges，pmp，pogo，POMA，PoTRA，powerTCR，POWSC，ppcseq，pqsfinder，婴儿车，preciseTAD，preciseTADhub，PrecisionTrialDrawer，王子，profileplyr，profileScoreDist，后代，projectR，pRoloc，pRolocGUI，适当的，Prostar，proteasy，ProteoDisco，ProteoMM，PSEA，PSMatch，ptairData，ptairMS，PureCN，PWMEnrich，qcmetrics，QDNAseq，QFeatures，qmtools，qpgraph，qsea，qsmooth，QSutils，qsvaR，Qtlizer，quantiseqr，quantro，QuasR，R3CPET，RadioGx，RaggedExperiment，雨，ramwas，RandomWalkRestartMH，randRotation，RAREsim，rat2302frmavecs，rawrr，Rbowtie，Rbwa，Rcade，rcellminer，rcellminerData，rCGH，RcisTarget，Rcwl，RcwlPipelines，RCX，RCy3，RCyjs，rDGIdb，ReactomePA，重新计票，recount3，recountmethylation，recountWorkflow，收回，红色的，RedisParam，地区，regioneReloaded，regsplice，regutools，ReQON，ResidualMatrix，解决，restfulSE，rexposome，rfaRm，Rfastp，RforProteomics，rfPred，RGMQL，RGMQLlib，RgnTX，rgoslin，RGraph2js，RGSEA，rhdf5，rhdf5client，rhdf5filters，Rhdf5lib，Rhisat2，Rhtslib，RiboCrypt，RiboProfiling，riboSeqR，ribosomeProfilingQC，rifi，河，RJMCMCNucleosomes，RLHub，RLSeq，RMassBank，rmspc，RNAmodR，RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。数据，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq，RNAseq123，rnaseqcomp，RnaSeqSampleSize，RnaSeqSampleSizeData，Rnits，ROCpAI，的方式，ropls，rprimer，rpx，rqt，rrvgo，Rsamtools，rScudo，rsem，rSWeeP，RTCGAToolbox，研制，RTNduals，RTNsurvival，Rtpca，rTRM，RUVSeq，旅游房车，rWikiPathways，S4Vectors，sampleClassifier，sampleClassifierData，sangerseqR，土星，ScaledMatrix，scanMiR，scanMiRApp，scanMiRData，scATAC。资源管理器，嘘，scBubbletree，scCB2，scClassify，sccomp，scDblFinder，scDD，scDDboost，scds，scFeatureFilter，scif里面，SCLCBam，scMerge，SCnorm，司康饼，scoreInvHap，scp，scPCA，scpdata，食物，scReClassify，ScreenR，scRepertoire，scRNAseq，颈背，scTreeViz，天窗，sechm，segmentSeq，selectKSigs，seqArchR，seqCAT，SeqGate，seqLogo，seqPattern，seqsetvis，SeqSQC，测序，SeqVarTools，芝麻，SEtools，sevenC，SGSeq，SharedObject，shinyMethyl，ShortRead，SIAMCAT，SigCheck，SigFuge，signatureSearch，signifinder，SigsPack，SimBenchData，SIMD，SimFFPE，similaRpeak，SIMLR，simpleSeg，sincell，单，Single.mTEC.Transcriptomes，SingleCellExperiment，SingleCellMultiModal，singleCellTK，单，singscore，SingscoreAMLMutations，sitePath，激流回旋，弹弓，SMAD，snapcount，一口，SNPediaR，SNPhood，SNPhoodData，soGGi，寄居，SOMNiBUS，麻雀，sparseDOSSA，sparseMatrixStats，sparsenetgls，SparseSignatures，spaSim，SpatialCPie，spatialDE，SpatialExperiment，SpatialFeatureExperiment，spatialHeatmap，spatialLIBD，specL，光谱，SpectralTAD，SPIAT，spicyR，SpidermiR，飞溅，分裂，splots，SpotClean，关注的焦点，spqn，SPsimSeq，sRACIPE，srnadiff，sSNAPPY，经验丰富的人，斯坦，StarBioTrek，STATegRa，Statial，statTarget，STdeconvolve，STexampleData，strandCheckR，结构体，Structstrings，structToolbox，SubCellBarCode，追求者，SummarizedBenchmark，SummarizedExperiment，股东价值分析，svaRetro，swfdr，switchde，突触，synapter，synaptome.data，SynExtend，syntenet，systemPipeR，systemPipeRdata，systemPipeShiny，systemPipeTools，TabulaMurisData，TabulaMurisSenisData，TADCompare，tanggle，TAPseq，TargetDecoy，TargetSearch，鞑靼，TBSignatureProfiler，TCGAbiolinks，TCGAbiolinksGUI，TCGAbiolinksGUI.data，TCGAutils，TEKRABber，TENxBrainData，TENxBUSData，TENxIO，TENxPBMCData，TENxVisiumData，terraTCGAdata，TFARM，TFBSTools，TFHAZ，TFutils，tidybulk，tidySingleCellExperiment，tidySummarizedExperiment，tigre，TileDBArray，timecoursedata，timeOmics，TimerQuant，tissueTreg，TMExplorer，TMixClust，烤面包，但在，tomoseqr，topconfects，topdownr，ToxicoGx，泛太平洋伙伴关系，tracktables，trackViewer，TrajectoryUtils，transcriptogramer，transcriptR，transomics2cytoscape，TraRe，tra利用，旅行，TreeAndLeaf，treekoR，TreeSummarizedExperiment，TREG，时尚的，一绺头发，三轮车，tripr，tRNA，tRNAdbImport，tRNAscanImport，TRONCO，TTMap，肺结核，TurboNorm，TVTB，twoddpcr，txcutr，UCell，UCSCRepeatMasker，Ularcirc，UMI4Cats，uncoverappLib，UniProt.ws，updateObject，variancePartition，VariantAnnotation，VariantFiltering，变体，VariantToolsData，VCFArray，VDJdive，VectraPolarisData，伶盗龙，左页，vidger，ViSEAGO，vissE，“航行者”号，vsclust，vsn，西瓜，wavClusteR，WeberDivechaLCdata，weitrix，个字，xcms，xcore，Xeva，XNAString，山药，YAPSA，zebrafishRNASeq，zellkonverter，天顶，zinbwave
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocStyle_2.26.0.tar.gz
Windows二进制	BiocStyle_2.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	BiocStyle_2.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	BiocStyle_2.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocStyle
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocStyle
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BiocStyle/
软件包下载报告	下载数据