BumpyMatrix

DOI:10.18129 / B9.bioc.BumpyMatrix

非标量对象的颠簸矩阵

Bioconductor版本:发行版(3.16)

实现BumpyMatrix类和几个子类,用于在矩阵的每个条目中保存非标量对象。这类似于一个粗糙的数组,但粗糙是在第三维度,很像一个凹凸不平的表面-因此得名。特别有趣的是BumpyDataFrameMatrix,其中每个条目都是一个Bioconductor数据帧。这允许我们以一种与二维容器(如summarizeexperiment和MultiAssayExperiment对象)兼容的格式自然地表示多元数据。

作者:Aaron Lun [aut, cre],基因泰克公司[cph]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“BumpyMatrix”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BumpyMatrix”)

超文本标记语言 R脚本 BumpyMatrix类
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews DataRepresentation基础设施软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 MIT +文件许可证
取决于
进口 跑龙套、方法矩阵S4VectorsIRanges
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL //www.andersvercelli.com/packages/BumpyMatrix
BugReports https://github.com/LTLA/BumpyMatrix/issues
全靠我
进口我 CoreGxMerfishDataMouseGastrulationData
建议我 ggspavisSpatialExperimentSTexampleData
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 BumpyMatrix_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 BumpyMatrix_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) BumpyMatrix_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) BumpyMatrix_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BumpyMatrix
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BumpyMatrix
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/BumpyMatrix/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/BumpyMatrix/
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