Bioconductor版本:发行版(3.16)
实现BumpyMatrix类和几个子类,用于在矩阵的每个条目中保存非标量对象。这类似于一个粗糙的数组,但粗糙是在第三维度,很像一个凹凸不平的表面-因此得名。特别有趣的是BumpyDataFrameMatrix,其中每个条目都是一个Bioconductor数据帧。这允许我们以一种与二维容器(如summarizeexperiment和MultiAssayExperiment对象)兼容的格式自然地表示多元数据。
作者:Aaron Lun [aut, cre],基因泰克公司[cph]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“BumpyMatrix”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BumpyMatrix”)
超文本标记语言 | R脚本 | BumpyMatrix类 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 跑龙套、方法矩阵,S4Vectors,IRanges |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/BumpyMatrix |
BugReports | https://github.com/LTLA/BumpyMatrix/issues |
全靠我 | |
进口我 | CoreGx,MerfishData,MouseGastrulationData |
建议我 | ggspavis,SpatialExperiment,STexampleData |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BumpyMatrix_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | BumpyMatrix_1.6.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | BumpyMatrix_1.6.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | BumpyMatrix_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BumpyMatrix |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BumpyMatrix |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BumpyMatrix/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BumpyMatrix/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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支持»
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