CancerInSilico

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerInSilico

一个R界面肿瘤恶化的计算模型

Bioconductor版本:版本(3.17)

CancerInSilico包提供了一个R界面运行数学模型的肿瘤progresson和生成的基因表达数据的结果。这个包在c++中实现底层模型和实现的输出和分析功能。

作者:托马斯·d·谢尔曼Raymond Cheng伊j .多数

维修工:托马斯·d·谢尔曼< tomsherman159 gmail.com >伊j .多数< ejfertig jhmi.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CancerInSilico”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,CellBiology,GeneExpression,ImmunoOncology,MathematicalBiology,RNASeq,SingleCell,软件,SystemsBiology
版本	2.20.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(7年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4), Rcpp
进口	方法,跑龙套,图形,统计数据
链接	Rcpp,黑洞
建议	testthat、knitr rmarkdown,BiocStyle,冬青Rtsne rgl gplots
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制	CancerInSilico_2.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	CancerInSilico_2.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerInSilico
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CancerInSilico
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CancerInSilico/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CancerInSilico/
包下载报告	下载数据