DMRcaller

DOI:10.18129 / B9.bioc.DMRcaller

调用者差异甲基化区域

Bioconductor版本:版本(3.17)

使用酸性亚硫酸盐测序数据之间的两个条件,识别差异甲基化区域的条件在CG和non-CG上下文。输入是残雪报告文件由俾斯麦和dmr的输出是一个列表存储为农庄组织对象。

作者:尼古拉·拉Zabet < n.r。在gen.cam.ac.uk zabet >,Jonathan Michael Foonlan Tsang , Alessandro Pio Greco and Ryan Merritt

维护人员:尼古拉·拉Zabet < n.r。在gen.cam.ac.uk zabet >

从内部引用(R,回车引用(“DMRcaller”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DMRcaller”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 DMRcaller
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文本 新闻

细节

biocViews 报道,DNAMethylation,DifferentialMethylation,测序,软件
版本 1.32.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(8年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5),GenomicRanges,IRanges,S4Vectors(> = 0.23.10)
进口 平行,Rcpp、RcppRoll betareg grDevices,图形,方法,属性,跑龙套
链接
建议 RUnit knitr,BiocGenerics
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 DMRcaller_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 DMRcaller_1.32.0.zip
macOS二进制(x86_64) DMRcaller_1.32.0.tgz
macOS二进制(arm64) DMRcaller_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DMRcaller
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DMRcaller
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DMRcaller/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/DMRcaller/
包下载报告 下载数据

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