延迟

doi:10.18129/b9.bioc.delayedarray

一个统一的框架,用于使用磁盘和内存阵列的数据集透明地工作

生物导体版本:版本(3.15)

将类似数组的对象(通常是盘中对象)包装在延迟的对象中,可以在不加载内存中加载对象的情况下对其执行公共数组操作。为了减少内存使用情况并优化性能,对象上的操作要么使用块处理机制延迟或执行。请注意,这也可用于类似内存数组的对象,例如DataFrame对象(通常带有RLE列),矩阵对象,普通数组和数据帧。

作者:gmail.com>>hervépagès和aaron lun >

维护者:hervépagès

引用(从r内,输入引用(“延迟”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ delayerDarray”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ delayedarray”)

PDF R脚本 delayedArray / HDF5Array更新
html 实施延迟的后端
PDF R脚本 在R中使用大型阵列
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,datarepresentation,,,,基因数,,,,基础设施,,,,软件
版本 0.22.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 4.0.0),方法,stats4,矩阵,,,,生物基因(> = 0.37.0),矩阵(> = 1.1.3),S4VECTORS(> = 0.27.2),iranges(> = 2.17.3)
进口 统计
链接 S4VECTORS
建议 生物比较,,,,HDF5Array(> = 1.17.12),GeneFilter,,,,总结性特征,,,,呼吸道,,,,lobstr,,,,延迟的matrixstats,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,运行
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/packages/delayedarray
BugReports https://github.com/bioconductor/delayedarray/issues
取决于我 延迟Dataframe,,,,延迟的matrixstats,,,,延迟派,,,,GDSARRAY,,,,HDF5Array,,,,安息,,,,休息,,,,Rhdf5client,,,,Scarray,,,,Singlecelltk,,,,TiledBarray,,,,vcfarray
进口我 Aucell,,,,Batchelor,,,,beachmat,,,,bigpint,,,,生物兴奋,,,,BSSEQ,,,,卡格,,,,Celaref,,,,塞尔达,,,,CellDex,,,,CEPO,,,,染色体,,,,簇发酵,,,,carpartmap,,,,CRISPRSEEK,,,,Cytomapper,,,,延迟Tensor,,,,DESCAN2,,,,液滴,,,,埃尔默,,,,ewce,,,,FlowWorkspace,,,,弗雷泽,,,,Genogam,,,,GenomicsCores,,,,Glmgampoi,,,,GSVA,,,,Hipathia,,,,imcdatasets,,,,loomexpermiment,,,,马卡龙,,,,mbkmeans,,,,甲基,,,,Methrix,,,,甲基化,,,,米娅,,,,迈维兹,,,,Minfi,,,,MOFA2,,,,Mudata,,,,mumosa,,,,NetSmooth,,,,新浪潮,,,,nxtirfcore,,,,正差,,,,PCATOOLS,,,,残留matrix,,,,rtcgatoolbox,,,,scaledmatrix,,,,评分,,,,scdblfinder,,,,Scmerge,,,,Scmeth,,,,SCPCA,,,,斯克兰,,,,scry,,,,砍伐,,,,SignaturesEarch,,,,Singlecellexperiment,,,,辛格,,,,总结性特征,,,,变换Gampoi,,,,TSCAN,,,,variantexperiment,,,,Velociraptor,,,,Weitrix,,,,xcore,,,,Zellkonverter
建议我 生物基因,,,,Chippeakanno,,,,cnvgears,,,,Gwascat,,,,爱马仕,,,,我明白,,,,桅杆,,,,Proteodisco,,,,S4VECTORS,,,,土星,,,,聚光灯,,,,sqldataframe,,,,轨迹
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 delayedArray_0.22.0.tar.gz
Windows二进制 delayedArray_0.22.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) delayedArray_0.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/delayedarray
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/delayerdarray
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/delayedarray/
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