ENmix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENmix

质量控制和分析工具Illumina公司DNA甲基化BeadChip

Bioconductor版本:版本(3.17)

质量控制工具,分析和visulization Illumina公司DNA甲基化数组的数据。

作者:Zongli徐(cre, aut),梁妞妞(aut)杰克•泰勒(施)

维护人员:徐Zongli < xuz在niehs.nih.gov >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ENmix”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ENmix”)

HTML	R脚本	ENmix用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,DNAMethylation,DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylationArray,微阵列,多通道,归一化,OneChannel,预处理,PrincipalComponent,质量控制,回归,软件,TwoChannel
版本	1.36.01
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5.0),并行,doParallel, foreach,SummarizedExperiment,统计数据
进口	grDevices、图形preprocessCorematrixStats,方法,跑龙套,geneplotter,嫁祸于,minfiRPMM,illuminaiodynamicTreeCut,IRangesgtools,Biobase,ExperimentHub,AnnotationHub,genefiltergplots quadprog,S4Vectors
链接
建议	minfiDataRUnit,BiocGenerics,BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/Bioconductor/ENmix
BugReports	https://github.com/Bioconductor/ENmix/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	ENmix_1.36.01.tar.gz
Windows二进制	ENmix_1.36.01.zip
macOS二进制(x86_64)	ENmix_1.36.01.tgz
macOS二进制(arm64)	ENmix_1.36.01.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ENmix
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ENmix/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ENmix/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档