HubPub

DOI:10.18129 / B9.bioc.HubPub

实用程序创建和使用Bioconductor集线器

Bioconductor版本:发行版(3.16)

HubPub为用户提供功能，以帮助Bioconductor Hub结构。该包提供了创建Hub样式包的框架的能力，然后用户可以用必要的信息填充该框架。还有一些函数可以帮助向Hub包元数据文件添加资源，以及将数据发布到Bioconductor S3 bucket。

作者:Kayla Interdonato [aut, cre]， Martin Morgan [aut]

维护者:Kayla Interdonato < Kayla。roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HubPub”)

超文本标记语言	R脚本	创建一个中心包:ExperimentHub或AnnotationHub
超文本标记语言	R脚本	HubPub:帮助发布Hub包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件，ThirdPartyClient
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	可用，usethis，biocthis，dplyr，aws.s3，fs，BiocManager,跑龙套
链接
建议	AnnotationHubData，ExperimentHubData，testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/HubPub/issues
全靠我
进口我
建议我	AnnotationHub，AnnotationHubData，ExperimentHub，ExperimentHubData
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	HubPub_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	HubPub_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	HubPub_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	HubPub_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HubPub
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HubPub
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HubPub/
软件包下载报告	下载数据