Bioconductor版本:发行版(3.16)
这是LRcell的外部实验数据包。该数据包包含从scRNA-seq数据集计算的基因富集分数,该数据集显示了大脑特定区域中每种细胞类型的基因富集程度。LRcell包用于识别特定的亚细胞类型,驱动在批量RNA-seq差异基因表达实验中观察到的变化。详情请访问:https://github.com/marvinquiet/LRcell。
维护者:马文静<文静。Ma在emory.edu>
引文(从R内,输入引用(“LRcellTypeMarkers”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“LRcellTypeMarkers”)
超文本标记语言 | R脚本 | LRcellTypeMarkers:使用Bioconductor's ExperimentHub为LRcell R Bioconductor包提供标记基因信息 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,PackageTypeData,RNASeqData,SingleCellData |
版本 | 1.6.0 |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | ExperimentHub |
链接 | |
建议 | LRcell,BiocStyle,knitr,rmarkdown,roxygen2,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/marvinquiet/LRcellTypeMarkers/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | LRcell |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | LRcellTypeMarkers_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制文件(x86_64) | |
macOS二进制文件(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LRcellTypeMarkers |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LRcellTypeMarkers |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/LRcellTypeMarkers/ |
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