Bioconductor版本:版本(3.17)
这个包适合Michaelis-Menten模型在单细胞RNASeq辍学的模式数据。这个模型作为零识别显著变量(即差异表达)基因用于下游分析,如聚类细胞。
作者:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >
维修工:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“M3Drop”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“M3Drop”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“M3Drop”)
R脚本 | 介绍M3Drop | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,DimensionReduction,FeatureExtraction,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录组 |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.4), numDeriv |
进口 | RColorBrewer、gplots bbmle、statmod grDevices,图形、属性、matrixStats,矩阵,irlba, reldist Hmisc,方法 |
链接 | |
建议 | knitr, ROCRM3DExampleData,嘘,SingleCellExperiment,单片眼镜修,Biobase |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/tallulandrews/M3Drop |
BugReports | https://github.com/tallulandrews/M3Drop/issues |
取决于我 | |
进口我 | scMerge |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | M3Drop_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | M3Drop_1.26.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | M3Drop_1.26.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | M3Drop_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/M3Drop |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ M3Drop |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/M3Drop/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/M3Drop/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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