MBECS

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBECS

微生物组数据集中批处理效应的评价与校正

Bioconductor版本:发行版(3.16)

微生物组批量效应校正套件(MBECS)提供了一组函数来评估和减轻由于批量处理而产生的未水噪声。为此，它从不同的包中集成了大量的批处理校正算法(BECA)。此外，它还提供了一个修正和报告管道，可以初步了解修正批处理效应前后数据集的特征。

作者:Michael Olbrich [aut, cre]

维护者:Michael Olbrich 上说

安装

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如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MBECS")

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文档

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超文本标记语言	R脚本	MBECS介绍
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细节

biocViews	BatchEffect，微生物组，归一化，质量控制，ReportWriting，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.1)
进口	方法,magrittr，phyloseq，limma，lme4，lmerTest，pheatmap，rmarkdown，集群，dplyr，ggplot2，gridExtra，ruv，股东价值分析，宠物猫，tidyr，素食主义者， stats, utils，矩阵
链接
建议	knitr，减价，BiocStyle，testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rmolbrich/MBECS
BugReports	https://github.com/rmolbrich/MBECS/issues/new
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MBECS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MBECS_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MBECS
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBECS
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MBECS/
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