米拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA

Methylation-Based推理的监管活动

Bioconductor版本:版本(3.17)

DNA甲基化包含的信息监管状态的细胞。米拉公司聚集成DNA甲基化DNA甲基化数据概要文件对于一个给定的地区设置共享生物注释。使用此配置文件,米拉推断和成绩的集体管理活动对该地区集。米拉促进监管分析古典监管的情况下分析将会困难,而且还要允许将公共资源地区集用于小说了解DNA甲基化数据集的管理状态。

作者:内森·谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut) Christoph烈性黑啤酒(施),约翰·劳森(aut (cre)

维护人员:约翰·劳森< jtl2hk virginia.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“米拉”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“米拉”)

HTML	R脚本	米拉应用到一个生物问题
HTML	R脚本	开始使用Methylation-based推理的监管活动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges、数据。表、ggplot2Biobase统计数据,bsseq、方法
链接
建议	testthat knitr,平行,BiocStylermarkdown,AnnotationHub,萝拉
SystemRequirements
增强了
URL	http://databio.org/mira
BugReports	https://github.com/databio/MIRA
取决于我
进口我	可可
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MIRA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	MIRA_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MIRA_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MIRA_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/米拉
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MIRA/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MIRA/
包下载报告	下载数据