MsBackendMassbank

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMassbank

MassBank记录文件的质谱数据后台

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱(MS)数据后台支持从MassBank记录文件导入和导出MS/MS库谱。不同的后端是可用的，允许在普通的MassBank文本文件格式的数据处理，也允许直接与MassBank SQL数据库交互。这个包中的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。因此，该包将MassBank支持添加到Spectra包中。

作者:rformassspectrometer Package Maintainer [cre]， Michael Witting [aut]，约翰·雷纳[au]，斯特拉夫斯[ctb]

维护者:rformassspectrometry.org的rformassspectrometry.org维护者<维护者

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMassbank”)

超文本标记语言	R脚本	MsBackendMassbank的描述和使用
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，基础设施，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，光谱(> = 1.5.17)
进口	BiocParallel，S4Vectors，IRanges、方法、ProtGenerics，MsCoreUtils，DBI,跑龙套
链接
建议	testthat，knitr(> = 1.1.0版),roxygen2，BiocStyle(> = 2.5.19),RSQLite，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMassbank/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MsBackendMassbank_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	MsBackendMassbank_1.6.1.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	MsBackendMassbank_1.6.1.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MsBackendMassbank_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMassbank
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMassbank
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendMassbank/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MsBackendMassbank/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.16的旧源包	源存档