Bioconductor版本:版本(3.17)
这个包实现了PAIRADISE程序检测微分同种型表达式之间的匹配在成对RNA-Seq复制数据。
作者:沛Demirdjian,应年,易建联兴
维修工:羌胡<羌族。胡锦涛在roswellpark.org >,沛Demirdjian < levondem ucla.edu >
从内部引用(R,回车引用(“PAIRADISE”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PAIRADISE”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“PAIRADISE”)
HTML | R脚本 | PAIRADISE |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.16.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(4年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6), nloptr |
进口 | SummarizedExperiment,S4Vectors、数据、方法、abindBiocParallel |
链接 | |
建议 | testthat、knitr rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | PAIRADISE_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAIRADISE_1.16.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | PAIRADISE_1.16.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | PAIRADISE_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAIRADISE |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/PAIRADISE/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PAIRADISE/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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