RNAAgeCalc

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAAgeCalc

multi-tissue转录年龄计算器

Bioconductor版本:版本(3.17)

它已经表明,DNA甲基化和RNA转录都与实足年龄和年龄相关的疾病。开发了几个估计预测人类衰老从DNA水平和RNA水平。大部分的人类转录年龄预测是基于微阵列数据和有限的只有少数组织。迄今为止,转录老龄研究使用RNASeq来自不同人体组织的数据是有限的。本方案的目的是提供一个工具across-tissue和组织转录年龄计算基于GTEx RNASeq数据。

作者:徐任(aut (cre),裴分矿(aut)

维护人员:徐任< xuren2120 gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAAgeCalc”)

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HTML	R脚本	RNAAgeCalc
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,RNASeq,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	ggplot2,重新计票,嫁祸于,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db统计数据,SummarizedExperiment、方法
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc
BugReports	https://github.com/reese3928/RNAAgeCalc/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAAgeCalc_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	RNAAgeCalc_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	RNAAgeCalc_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)	RNAAgeCalc_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAAgeCalc
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAAgeCalc
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RNAAgeCalc/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RNAAgeCalc/
包下载报告	下载数据