Rcwl

DOI:10.18129 / B9.bioc.Rcwl

公共工作流语言的R接口

Bioconductor版本:发行版(3.16)

通用工作流语言(CWL)是一种用于开发数据分析工作流的开放标准，它可以跨不同的工具和工作环境进行移植和扩展。Rcwl提供了一种简单的方法来包装命令行工具，并在r中以编程方式构建CWL数据分析管道。它增加了CWL管道的使用、开发和维护的便利性。

作者:胡强[aut, cre]，刘谦[aut]

维护者:强虎<强。在roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Rcwl”)

超文本标记语言	R脚本	Rcwl:公共工作流语言的R接口
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ImmunoOncology，软件，WorkflowStep
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2 |文件许可证
取决于	R (>= 3.6)，yaml、方法、S4Vectors
进口	跑龙套,统计数据,BiocParallel，batchtools，图，闪亮的，R.utils，codetools，蛇怪
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	RcwlPipelines
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Rcwl_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)	Rcwl_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	Rcwl_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rcwl
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rcwl
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Rcwl/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Rcwl/
软件包下载报告	下载数据