RcwlPipelines

DOI:10.18129 / B9.bioc.RcwlPipelines

基于Rcwl的生物信息学管道

Bioconductor版本:发行版(3.16)

基于R和公共工作流语言的生物信息学工具和管道的集合。

作者:胡强[aut, cre]，刘谦[aut]，高爽[aut]

维护者:强虎<强。在roswellpark.org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RcwlPipelines”)

超文本标记语言	R脚本	RcwlPipelines
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，DNASeq，DataImport，ImmunoOncology，预处理，质量控制，RNASeq，软件，WorkflowStep
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6)，Rcwl，BiocFileCache
进口	rappdirs，方法，utils，git2r，httr，S4Vectors
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements	nodejs
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	RcwlPipelines_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)	RcwlPipelines_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	RcwlPipelines_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RcwlPipelines
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RcwlPipelines
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/RcwlPipelines/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RcwlPipelines/
软件包下载报告	下载数据