RolDE

DOI:10.18129 / B9.bioc.RolDE

RolDE:稳健的纵向微分表达式

Bioconductor版本:发行版(3.15)

RolDE检测噪声高吞吐量数据中两种条件之间的纵向差异表达式。甚至适用于缺少适当数量值的数据。RolDEis a composite method, consisting of three independent modules with different approaches to detecting longitudinal differential expression. The combination of these diverse modules allows RolDE to robustly detect varying differences in longitudinal trends and expression levels in diverse data types and experimental settings.

作者:Tommi Valikangas

维护人员:Tommi Valikangas

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RolDE")

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文档

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browseVignettes(“RolDE”)

超文本标记语言	R脚本	简介
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文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，蛋白质组学，回归，软件，StatisticalMethod，TimeCourse
版本	1.0.0
在Bioconductor公司	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.2.0)
进口	统计数据、方法腐烂，matrixStats，foreach平行,doParallel，doRNG，rngtools，SummarizedExperiment，nlme，qvalue， grDevices，图形，utils
链接
建议	knitr，printr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/elolab/RolDE
BugReports	https://github.com/elolab/RolDE/issues
全靠我
进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RolDE_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	RolDE_1.0.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	RolDE_1.0.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RolDE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RolDE
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RolDE/
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