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单歌者
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DOI：10.18129 / b9.bioc.singler.
基于参考的单细胞RNA-SEQ注释
Bioconductor版本：释放（3.13）
通过利用纯细胞类型的参考转录组数据集来执行来自单细胞RNA测序数据的无偏见的细胞类型识别，以独立地推断每个单个电池的原点的单元。
作者：DVIR ARAN [AUT，CPH]，AARON LUN [CTB，CRE]，Daniel Bunis [CTB]，Jared Andrews [CTB]，FriederikeDündar[CTB]
维护者：Aaron LUN
引文（从R内，输入引文（“Singler”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“singler”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“Singler”）
| HTML. | r script. | 注释SCRNA-SEQ数据 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| Biocviews. | 注解那分类那聚类那基因表达那SingleCell.那软件那转录组学 |
| 版本 | 1.6.1. |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年） |
| 执照 | gpl-3 +文件执照 |
| 依靠 | 概括分析 |
| 进口 | 方法，矩阵那S4Vectors.那delayedarray那delayedmatrixstats那Biocneighbors.那生物相投那生物贴眼，统计数据，utils，rcpp.那海滩日， 平行 |
| 链接到 | rcpp.那海滩日 |
| 建议 | testthat.那kn那RAMAMAMDOW.那生物焦那生物根系那SinglecellexPeriment.那sc那撒尿那斯那scrnapeq.那ggplot2.那Pheatmap.，grdevices，格拉底那viridis.那celldex. |
| 系统要求 | C ++ 11. |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/ltla/singler. |
| Bugreports. | https://support.biocumon.org/ |
| 取决于我 | osca.advanced，OSCA.Basic，OSCA.MultIsample，OSCA.Workflows |
| 进口我 | singlecelltk. |
| 建议我 | TidysinglecellexPeriment. |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | singler_1.6.1.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | singler_1.6.1.zip.（32-＆64位） |
| Macos 10.13（高塞拉） | singler_1.6.1.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/singler. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/单数手 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/singler/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
| BIOC 3.13的旧源包 | 源档案 |
