概括分析

DOI：10.18129 / b9.bioc.summarizedoxperiment.

概述过分的容器

Bioconductor版本：释放（3.13）

概括的分析容器包含一个或多个测定，每个测定值由数字或其他模式的矩阵物体表示。行通常表示感兴趣的基因组范围，并且列代表样品。

作者：马丁摩根，Valerie Obenchain，Jim Hester，HervéPagès

维护者：Bioconductor Package维护者

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HTML.	r script.	1.协调实验测定，样本和感兴趣区域的总结
HTML.	r script.	2.扩展摘要分类类
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细节

Biocviews.	注解那覆盖范围那遗传学那GenomeanNotation.那基础设施那测序那软件
版本	1.22.0
在生物导体中以来	BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 4.0.0），方法，MatrixGenerics.（> = 1.1.3），Genomicranges.（> = 1.41.5），BioBase.
进口	Utils，stats，工具，矩阵那生物根系（> = 0.37.0），S4Vectors.（> = 0.27.12），绞喉（> = 2.23.9），Genomeinfodb.（> = 1.13.1），delayedarray（> = 0.15.10）
链接到
建议	HDF5Array.（> = 1.7.5），注释那annotationdbi.那hgu95av2.db.那基因组法那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那雅思石那RHDF5.那呼吸道那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那运行那testthat.那消化
系统要求
加强
URL.	https://biocumon.org/packages/summarizedexperiment.
Bugreports.	https://github.com/bioconductor/summarizedexperiment/issues.
取决于我	粘贴那呼吸道那等位基因矛纪那aspediafi.那Bambu.那BDMMACorrect.那BenchmarkFdrdata2019那Biocsklearn.那Biseq.那BNBC.那Bodymaprat.那Brainsaber.那BSSeq.那CageFightr.那Celaref.那celldex.那丁浓缩那Compartmap.那coregx.那COSEQ.那CSAW.那CSSQ.那ctggem.那施用adipochip.那腌覆盆子那腌制胶癌那Damireseq.那迪科那Deepsnv.那黛西那deseq2.那Dexseq.那困惑那DiffCoexp.那Diffhic.那分歧那DMCFB.那DMCHMM.那dmrcate.那梦想4.那DSQTL.那enmix.那enrichmentbrowser.那Epigenomix.那评价那eventPointer.那exoMepeak2.那实验器那表达式那盛宴那裂变那flowsorted.blood.epic.那flowsorted.CordbloodCombined.450K.那弗雷泽那genogam.那基因管理那基因组夫妇那Genomicsupersignature那Genoset.那Grmetrics.那GSEABENCHMARMARR.那hdcytodata.那Helloranges.那高度相似的rnaseq.那Hipathia.那hmp16sdata.那Iggenesage.那划那互动那兴趣那我懂了那Isomirs.那凡隘泻那lefser.那Lipidr.那索细那制作4.那matrixqcvis.那Mbased.那Metagxovarian.那metagxpancreas.那methrix.那甲基皮脂那methylseqdata.那METNET.那米娅那梅维兹那微生物针织品那micrornaome.那Minfi.那mirmine.那莫坦那mousegastrulationdata.那穆斯莱姆化那MPRA.那MultiAsaySayexperiment.那Nadfinder.那nbamseq.那新浪潮那obmiti.那探险者那PADMA.那甲状旁腺那PDATK.那phipdata.那profflewlactiple.那叙事那追叙3.那regenrich.那重新那休息那RESTFULSEDATA.那rocpai.那rqt.那赛道那sampleclassifierdata.那scale4c.那scclassifr.那SCGPS.那烤那SDAMS.那SEQGATE.那SGSEQ.那签名探索那simulatorz.那SinglecellexPeriment.那singlecelltk.那单歌者那Soggi.那SPQN.那spqndata.那沙拉群岛那sspaths.那stager.那摘要博马克那survtype.那TidySummarizedexperiment.那TimeCoursedata.那TimeSeriesexperiment.那组织胸肉那TNBC.CMS.那umi4cats.那香草那VariantAnnotation.那variantexperiment.那Velociraptor.那Weitrix.那山姆斯那Zinbwave.
进口我	亚当那admumute.那AggregateBiovar.那航空公司那aldex2.那高寒那阿尔普斯纳姆那蚕豆那Anota2seq.那Apalyzer.那apeglm.那嗯那asics.那Aucell.那自主学那啊那Barcodetrackr.那基本那batchelor.那拜士斯佩斯那贝诺那Bbcanalyzer.那重音那Bioconcotk.那Bionero.那生物墨呢那Biovizbase.那Biscuiteer.那Biseq.那Blacksheepr.那Bloodcancermultiomics2017那血液3module.那Bradata.那Brgenomics.那BumHmm.那Buscorrect.那ca那蛋糕那催化剂那cbioportaldata.那ccfindr.那celda.那克里米尔那cellmixs.那蜂窝线那CENSCET.那CETF.那Chetah.那Chippeakanno.那Chromscape.那Chromvar.那citefuse.那Cllmethylation那CLUSTIFYR.那CMAPR.那cnvfilter.那cnvranger.那coexnet.那Cogaps.那Combi.那结论那调味品那共识那CopyNumberplots.那腐蚀那宇宙.67那countsimqc.那Crossmeta.那CutatedTCGADATA.那Cydar.那Cytomapper.那DAMEFINDER.那司布那黛米卡那德布雷斯勒那decomplexdisease.那decomptumor2sig那畸形那重新评估那deltacapturec那张那descan2.那命运那德沃瑟那diffcyt.那差异那过度性那清楚的那dittoseq.那多米诺骨牌效应那DOPPELGANGR.那辅修那Dropletuls.那沙丘那easyrnaseq.那Eisar.那埃尔默那emtdata.那Ensemblvep.那epialler那epigrahmm那Epivizrdata.那erma.那ewce.那exphuntersuite.那FCBF.那FcScan.那FieldEffectCrc.那鱼池那荧光酶学那gar那Gcrisprtools.那genetonic.那GenomicDataComons.那getDee2.那GGBIO.那光明那glmgampoi.那GLMSParsenet.那Gnet2.那格拉姆4R.那格雷比亚斯核糖那Gscreend.那GSE13015那GSVA.那Gwasurvivr.那格纳那hmp2data.那htseqgenie.那HumantranscriptomeCompendium.那蜂鸟那IASVA.那冰茶那理想的那ihwpaper.那iloreg.那地狱那检查那潮流器那Iseeu.那迭代那蕾丝那线程普利那李森林那Madseq.那摩尔那桅杆那MBKmeans.那MBQN.那McSea.那一顿饭那肉那兆那代谢莫罗马族营运票那Metagxbreast.那Metaneighbor.那METASEQR2.那methreg.那甲烷分析那METHYLAID.那甲基座那弥撒那米莎拉那mil那最小值那米尔拉布那Mirsm.那MissMethyl.那MLSEQ.那moonlightr.那MotifBreakr.那motifmatchr.那mpranalyze.那MSFeatures.那msgbsr.那msprep.那MSQROB2.那多atAdataset.那multiomicsviz那穆斯萨那马斯喀特那Musicatk.那mwastools.那nanomethviz那空白山脉那netsmooth那诺斯那armanalyzerde.那oligoclasses.那omicrexposome.那omicslonda.那omicsprint.那oncomix.那orfik.那oveseg.那锥形那pcaexplorer.那佩奇那Pharmacogx.那PHEMD那Phapopath那Phosr.那pipecomp.那PMP.那Powsc.那Proactiv.那博士那Psichomics.那Pulsedsilac.那pur那qfeatures.那qsmooth.那Quantiseqr.那r453plus1toolbox.那radiogx.那raggedexperiment.那Rarevariantvis.那rcistarget.那接收器那RegionReport.那regsplice.那RGSEPD.那rmmuant.那rnaagecalc.那rnasense.那怒吼那rscudo.那rtcgatoolbox.那rtn.那土星那SBGNVIEW.那SC3那斯科靠那撒尿那SCBFA那SCCB2.那scdblfinder.那SCDD.那SCDS.那Schot.那SCMAP.那骗子那抚慰那斯通那得分invhap.那SCP.那SCPIPE.那斯那Skerpertoire.那scrnapeq.那颈背那斯克里那SCTERSOR.那SCTGIF.那sc那塞赫姆那SEQCAT.那芝麻那setools.那sigfeature.那Sigspack.那singlecell multimodal.那斯嘉西尔那singscoreamlmutations.那sl那弹弓那sl那snapcount.那斯文那西班牙猎犬那spatialcpie.那Spatiamesxperiment.那spatialheatmap.那spatiallibd.那泼溅那拼接物质那Srnadiff.那塑造那售货员那转换器那Systempiper.那systempipetools.那TBSignatureProfiler.那tcgabiolinks.那tcgabiolinksgui.那tcgautils.那tcgaworkflow.那tcgaworkflowdata.那Tcseq.那tenxplore.那Tidybulk.那TidysinglecellexPeriment.那吐司那Tomoda.那Topaseq.那毒素那TRADESEQ.那traometoryutils.那tr那树ummariedexperiment.那时髦的那三轮车那TSCan.那TSCR.那Tsrchitect那ttmap.那TVTB.那tximeta.那变型滤波器那vidger.那WPM.那XCMS.那Zellkonverter.那ZFPKM.
建议我	annotationhub.那生物室那biocpkgtools.那biotmlowata.那CageWorkflow.那腌制那dcanr.那DCE.那亲爱的那delayedarray那多萝西娅那Duoclustering2018那edger.那enmcb.那Epivizr.那Epivizrchart.那esetvis.那fobitools.那Genie3.那Genomicranges.那GlobalSeq.那GSean.那HDF5Array.那信息那InteractiveComplexHeatMap.那互动神血那MatrixGenerics.那Mistyr.那MOFA2.那msnbase.那pathwaypca.那Podkat.那PUBSCORE.那林葛普查组织那riboprofiling那S4Vectors.那sbgnview.data.那scfeaturefilter那Semolup.那StrafturalVariantAnnotation.那systempiphine那tfutils.那tissuetreg.
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源包	概述_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	摘要_22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	概述_periment_1.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/summarizedexperiment.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/概括声明
包短网址	https://biocumon.org/packages/summarizedexperiment/
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