TargetSearch

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetSearch

GC-MS代谢物谱数据分析包

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包为GC-MS数据的针对性预处理提供了一种灵活、快速、准确的方法。用户提供一套(通常是非常大的)气相色谱图和目标的代谢物库。该软件包将自动在色谱图中搜索这些目标，从而生成可用于进一步数据分析的数据矩阵。

作者:Alvaro Cuadros-Inostroza [aut, cre]， Jan Lisec [aut]， Henning Redestig [aut]， Matt Hannah [aut]

维护者:Alvaro Cuadros-Inostroza

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TargetSearch”)

PDF	R脚本	RI校正额外
PDF	R脚本	TargetSearch包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DecisionTree，ImmunoOncology，MassSpectrometry，预处理，软件
版本	2.0.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(14年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口	图形，grDevices，方法，ncdf4，统计，utils，为了
链接
建议	TargetSearchData，BiocStyle，knitr，tinytest
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/acinostroza/TargetSearch
BugReports	https://github.com/acinostroza/TargetSearch/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	TargetSearch_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	TargetSearch_2.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	TargetSearch_2.0.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	TargetSearch_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetSearch
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetSearch
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TargetSearch/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TargetSearch/
软件包下载报告	下载数据