txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.

DOI:10.18129 / b9.bioc.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.kknowngene.

TXDB对象的注释包

Biocometiond版本:释放(3.12)

通过将其暴露为TXDB对象,公开从UCSC生成的注释数据库

作者:Marc Carlson,Bioconductor PaciteNativeer [CRE]

维护者:Bioconductor Package维护者

引文(从R内,输入引文(“txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!propenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

PDF. 参考手册

细节

Biocviews. annotationdata.遗传学homo_sapiens.TXDB.
版本 3.2.2
执照 艺术-2.0
依靠 基因组法(> = 1.21.30)
进口 annotationdbi.
链接到
建议
系统要求
加强
URL.
取决于我 注解嵌合体Fdb.infiniummethylation.hg19.funcisnp.homo.sapiens.变体vulcan.
进口我 阿尔卑斯山chipqc.ChipSeeker.decomptumor2sig希尔达Musicatk.邻近profflewlactiple.Rarevariantvis.rcgh.umi4cats.undodapplib.
建议我 等位基因矛纪annotationdbi.annotatr.Atacseqqc.BeadarrayBioconcotk.生物相投Biomvrcns.Biovizbase.Bumphunter.cgdv17.chipenrich.data.Chippeakanno.Chromplot.cpvsnp.Crispseek.德内捷德derfinderplotesatac.弗雷泽Ga4ghclient.Ga4ghshiny.基因测定创世纪基因管理基因组法Genomicranges.基因组织Genvisr.GGBIO.GMAPR.gqtlstats.GROHMMGUIDESEQ.Gwascathtseqgenie.inpas.Karyploter.桅杆meskit.甲烷分析mutationalpatterns.诺斯探险者网页排名purR3CPET.RegionReport.riboprofilingrtracklayer.SGSEQ.sigfuge.拼接照片概括分析tcgautils.tfea.chip.TrackViewer.经纪人tximport.VariantAnnotation.变型滤波器
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源包 txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene_3.2.2.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉)
包短网址 https://biocumon.org/packages/txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene/
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