affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips

Bioconductor版本:版本(3.17)

各种包装器函数,写精简分析核心生物可能会看到更为普遍。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affycoretools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affycoretools”)

HTML	R脚本	创建带注释的输出与\ Biocpkg {affycoretools}和ReportingTools
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件
版本	1.72.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(17岁)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase、方法
进口	affy,limma,GOstats,gcrma样条函数、xtableAnnotationDbiggplot2 gplots,oligoClasses,ReportingToolshwriter晶格,S4Vectors,刨边机RSQLite,BiocGenericsDBI,Glimma
链接
建议	affydata,hgfocuscdf,BiocStyleknitr,hgu95av2.db、rgl rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AgiMicroRna
进口我
建议我	EnMCB
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	affycoretools_1.72.0.tar.gz
Windows二进制	affycoretools_1.72.0.zip
macOS二进制(x86_64)	affycoretools_1.72.0.tgz
macOS二进制(arm64)	affycoretools_1.72.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affycoretools
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/affycoretools/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/affycoretools/
包下载报告	下载数据