bandle

DOI:10.18129 / B9.bioc.bandle

一个R包用于差分亚细胞定位实验的贝叶斯分析

Bioconductor版本:发行版(3.15)

Bandle包可以使用质谱数据对差分定位实验进行分析和可视化。支持的实验方法包括动态LOPIT-DC, hyperLOPIT，动态细胞器映射，动态PCP。它提供Bioconductor基础设施来分析这些数据。

作者:Oliver M. Crook [aut, cre]，丽莎·布雷克尔斯[au]

维护者:Oliver M. Crook < Oliver。骗子在stats.ox.ac.uk >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bandle")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“bandle”)

超文本标记语言	R脚本	用BANDLE分析微分定位实验:Vignette
超文本标记语言	R脚本	用BANDLE分析微分定位实验:Vignette 2
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，分类，聚类，DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，蛋白质组学，质量控制，软件
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1),S4Vectors，Biobase，MSnbase，pRoloc
进口	Rcpp(> = 1.0.4.6),pRolocdata，lbfgs，ggplot2，dplyr，plyr，knitr、方法、BiocParallel，robustbase，BiocStyle，ggalluvial，ggrepel，tidyr，circlize，图形，统计，utils, grDevices，rlang
链接	Rcpp，RcppArmadillo，黑洞
建议	coda(> = 0.19 4),testthat，插值函数，字段，pheatmap，冬青，rmarkdown，拼写
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/ococrook/bandle
BugReports	https://github.com/ococrook/bandle/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	bandle_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	bandle_1.0.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bandle_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bandle
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bandle
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bandle/
包下载报告	下载数据