啤酒

DOI:10.18129 / B9.bioc.beer

R中的贝叶斯富集估计

Bioconductor版本:Release (3.15)

BEER实现了一个分析噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)数据的贝叶斯模型。给定一个PhIPData对象，BEER返回丰富抗体反应的后验概率，相对于阴性对照样本的相对折叠变化的点估计，等等。此外，BEER提供了一种方便的实现，用于使用edgeR来识别富集的抗体反应。

作者:Athena Chen [aut, cre]， Rob Scharpf [aut]， Ingo Ruczinski [aut]

维护者:Athena Chen

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("beer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“啤酒”)

超文本标记语言	R脚本	啤酒
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯，报道，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.2.0)，PhIPData(> = 1.1.1),rjags
进口	cli，刨边机，BiocParallel、方法、progressr统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),BiocStyle，covr，knitr，rmarkdown，dplyr，ggplot2，拼写
SystemRequirements	安装缺口(4.3.0)
增强了
URL	https://github.com/athchen/beer/
BugReports	https://github.com/athchen/beer/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	beer_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	beer_1.0.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	beer_1.0.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beer
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/beer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/beer/
软件包下载报告	下载数据