bioCancer

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioCancer

交互式多组学癌症数据可视化与分析

Bioconductor版本:发行版(3.16)

bioCancer是一款可视化和交互式分析癌症基因组数据的多分析应用程序。

作者:Karim Mezhoud [aut, cre]

维护者:Karim Mezhoud

引文(从R内,输入引用(“bioCancer”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“bioCancer”)

超文本标记语言 R脚本 生物癌症:交互式多组学癌症数据可视化和分析
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataRepresentationGUIGeneExpressionGeneTargetMultipleComparison网络通路Reactome软件可视化
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证 AGPL-3 |文件许可证
取决于 R (>= 3.6.0),radiant.data(> = 0.9.1),XML(> = 3.98)
进口 R.ooR.methodsS3httrDT(> = 0.3),dplyr(> = 0.7.2),闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(>= 1.1.0),方法AnnotationDbishinythemesBiobasegeNetClassifierorg.Hs.eg.dborg.Bt.eg.db剂量clusterProfilerreactome.dbReactomePA(< = 1.01),visNetworkhtmlwidgetsplyr宠物猫GO.db
链接
建议 BiocStyleprettydocrmarkdownknitrtestthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 bioCancer_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 bioCancer_1.26.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) bioCancer_1.26.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bioCancer
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/bioCancer/
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