Bioconductor版本:Release (3.15)
biodbHmdb库是biodb框架包的扩展,提供对HMDB代谢物数据库的访问。它允许在本地下载整个HMDB代谢物数据库,访问条目并通过名称或描述搜索条目。该软件包的未来版本还将包括质量搜索和质谱注释。
维护者:Pierrick Roger < Pierrick。收到,在cea.fr>
引文(从R内,输入引用(“biodbHmdb”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biodbHmdb”)
超文本标记语言 | R脚本 | biodbHmdb包的介绍。 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
许可证 | AGPL-3 |
取决于 | R (>= 4.1) |
进口 | R6,biodb(> = 1.3.2),Rcpp |
链接 | Rcpp,testthat |
建议 | BiocStyle,roxygen2,devtools,testthat(> = 2.0.0),knitr,rmarkdown,covr,lgr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pkrog/biodbHmdb |
BugReports | https://github.com/pkrog/biodbHmdb/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | biodbHmdb_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | biodbHmdb_1.2.0.zip(64位) |
macOS二进制文件(x86_64) | biodbHmdb_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biodbHmdb |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/biodbHmdb |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/biodbHmdb/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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支持»
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