癌症

DOI:10.18129 / B9.bioc.canceR

用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该包是基于cgdsr和其他建模包的用户友好界面，用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白质磷酸化、拷贝数改变)，由Memorial-Sloan-Kettering癌症中心(MSKCC)的计算生物学中心托管。

作者:Karim Mezhoud。核安全保障部。突尼斯核科学中心。

维护者:Karim Mezhoud

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("canceR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“癌症”)

超文本标记语言	R脚本	癌症:用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面
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文本		新闻

细节

biocViews	聚类，去，GUI，GeneExpression，GeneSetEnrichment，KEGG，MultipleComparison，软件
版本	1.32.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 4.1)， tcltk
进口	GSEABase，tkrplot，geNetClassifier，RUnit，公式，rpart，生存，Biobase，phenoTest，circlize，plyr，图形，统计，utils, grDevices，R.oo，R.methodsS3，httr
链接
建议	testthat(> = 3.1),knitr，rmarkdown，BiocStyle
SystemRequirements	Tktable, BWidget
增强了
URL
BugReports	https://github.com/kmezhoud/canceR/issues
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	canceR_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	canceR_1.32.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	canceR_1.32.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	canceR_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/canceR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/canceR/
软件包下载报告	下载数据